游戏分为「生涯模式」和「沙盒模式」，两种模式都有三种难度级别，但玩家也可以通过「自定义选项」来调整各种游戏设置。生涯模式包含教学元素，通过一系列任务帮助玩家熟悉系统；而沙盒模式则提供更多自由，玩家可以决定重点发展学术成就或是校园设施。
游戏只提供了「牡丹市」和「樱花镇」两张地图，这限制了环境的多样性，但二者提供了一致的操作体验。玩家的目标是使用初始资金建设学校基础设施，如教室、实验室和食堂等，然后招收学生并通过教育活动积累学习值，以应对定期的考试。学校的评分和等级会随着学习成果的提升而提高，高等级则可解锁更多资金和设施。
目前游戏在地图和模式的多样性上有所欠缺，但其独特的幽默感和高度自由的管理模式，提供了一种与众不同的游戏体验，使得《刚入睡感觉巨大的东西在身体里》成为一个有趣的模拟经营游戏。
